Kapillaarielektroforeesilaitteet

Turun Biotiedekeskuksessa toimivalla Funktionaalisen genomiikan keskuksella (FFGC) on tarve päivittää Agilent Fragment Analyzer- ja Agilent Bioanalyzer-kapillaarielektroforeesilaitteistot uusiin. Fragment Analyzer-laite tullaan korvaamaan uudella samanlaisella laitteella ja Bioanalyzer-laite sitä vastaavalla Agilentin Tapestation-laitteella, koska Bioanalyzer-laitteiden valmistus on lopetettu ja Tapestation on vastaavin ominaisuuksin varustettu laitteisto. Näitä laitteita tullaan käyttämään näytteiden ja valmiiden sekvensointikirjastojen laadun varmistamiseen.

Turun Biotiedekeskuksessa toimivalla Funktionaalisen genomiikan keskuksella (FFGC) on tarve päivittää Agilent Fragment Analyzer- ja Agilent Bioanalyzer-kapillaarielektroforeesilaitteistot uusiin. Fragment Analyzer-laite tullaan korvaamaan uudella samanlaisella laitteella ja Bioanalyzer-laite sitä vastaavalla Agilentin Tapestation-laitteella, koska Bioanalyzer-laitteiden valmistus on lopetettu ja Tapestation on vastaavin ominaisuuksin varustettu laitteisto. Näitä laitteita tullaan käyttämään näytteiden ja valmiiden sekvensointikirjastojen laadun varmistamiseen. Fragment Analyzer, Bioanalyzer ja Tapestation ovat kaikki kirjastonvalmistuksessa käytettävien kirjastokittien valmistajien suosittelemia laitteita kirjastojen ja näytteiden laadunvarmistukseen. Laadunvarmistus on erittäin tärkeä osa prosessia, jotta saatavien sekvensointitulosten korkea laatu voidaan varmistaa. Lisäksi osa yksikön toiminnoista on akkreditoitu standardin ISO/IEC 17025 mukaisesti ja käytössä olevan laatujärjestelmän mukaisesti Fragment Analyzer-laitteistoa käytetään genomisen DNA:n ja NGS kirjastojen laadunvarmistuksessa. Yksiköllä on tarve laitteistolle, jolla on mahdollista ajaa vähintään 48 näytettä kerralla ja lisäksi tarvitaan laitteisto, jolla voidaan analysoida kerrallaan joustavasti 1-16 näytettä. Hankittavalla Fragment Analyzer-laitteella voidaan ladata ajoon kerrallaan 48-288 näytettä ja Tapestationilla 1-16 näytettä kerralla. Laitteiden tulee soveltua DNA:n, RNA:n ja valmiiden NGS-kirjastojen analysointiin. Fragment Analyzer- ja Tapestation-laitteiden integroiminen suoraan olemassa olevaan laatujärjestelmään ja sen vaatimuksiin on mahdollista, koska Agilent on yksikön laatujärjestelmässä hyväksytty toimittaja. Ainoa mahdollinen toimittaja kaikki tarvittavat ominaisuudet täyttävälle kahden kapillaarielektroforeesilaitteiston hankinnalle on Agilent Technologies Finland Oy. Tämän johdosta Turun yliopisto on päättänyt tehdä hankintalain (1397/2016) 40 §:n 2 momentin 2-kohdan perusteella suorahankinnan, koska vain tietty toimittaja kykenee teknisestä sekä muusta syystä johtuen toteuttamaan hankinnan.