Integroitu digitaali-PCR-laite

Hankinnan kohteena on Ruokavirastoon käyttöön tuleva kammiopohjainen digitaali-PCR-tekniikalla toimiva laite (chamber based digital-PCR = cdPCR) useiden eri DNA- ja RNA-emäsjaksojen (sekvenssien) tunnistamiseksi. Johtuen monipuolisista analyysitarpeista, hankittavan laitteiston tulee soveltua sekä laajamittaiseen seulonta-analytiikkaan että korkean resoluution kvantitatiivisiin analyyseihin.

Hankinnan kohteena on Ruokavirastoon käyttöön tuleva kammiopohjainen digitaali-PCR-tekniikalla toimiva laite (chamber based digital-PCR = cdPCR) useiden eri DNA- ja RNA-emäsjaksojen (sekvenssien) tunnistamiseksi. cdPCR:ää tullaan käyttämään useiden erilaisten biologisten tekijöiden seulonnoissa ja kvantitoinneissa. Näitä ovat esimerkiksi ihmisille ja eläimille haitalliset ja vaaralliset taudinaiheuttajat (esim. salmonella ja norovirus sekä muut elintarvikkeiden välityksellä leviävät taudinaiheuttajat sekä eläimille tautia aiheuttavat bakteerit, virukset ja muut mikrobit), antibioottiresistenssigeenejä kantavat mikrobit, siirtogeeniset organismit (kasvit tai mikrobit) sekä lukuisat erilaiset kasvitautien aiheuttajat. Sen vuoksi hankittavan cdPCR-laiteen tulee soveltua useiden erityyppisten laboratorioanalyysien tekoon siinä käytettäviä kammiolevyjä ja reagensseja varioimalla. Laitteella tulee pystyä analysoimaan geneettistä materiaalia, joka voi olla lähtökohtaisesti DNA:ta tai RNA:ta. RNA - analytiikassa käänteiskopiointi olisi hyvä tapahtua samassa ajossa kvantitoinnin kanssa mm. kontaminaatioiden välttämiseksi. Hankittavan laitteen tulee vastata lisääntyviin analyysitarpeisiin, joten sen on oltava mukautumiskykyinen ja skaalautuva. Hankittavan cdPCR-laitteen tulee koostua yhdestä laiteyksiköstä ja mahdollisesta erillisestä tietokoneesta sekä laitteen ohjaukseen käytettävästä tietokoneohjelmasta, jonka avulla analyysidata voidaan prosessoida nopeasti ja luotettavasti. Hankinnan kohde sisältää lisäksi cdPCR-laitteen toimituksen toimitusehdon mukaisesti, käyttöohjeet, teknisen dokumentoinnin ja laitteen käyttökuntoon asentamisen sekä ohjelmiston asennuksen ja optimoinnin käyttökuntoon, testaukset, alkuperehdytyksen ja lisäkoulutuksen sekä asiakaspalvelun. Hankinnan kohde sisältää lisäksi vuosihuollon ja vikakorjauspalvelun sekä laitteen käyttöön tarvittavat tarvikkeet 2500 näytteen korkean resoluution analyysiin.

Hankinnasta tehdään toistaiseksi voimassaoleva sopimus.