NGS sekventointilaite

Hankinnan kohteena on NGS sekventointilaitteen hankinta. Hankittava laite korvaa v. 2015 hankitun laitteen ja se tulee toimimaan rinnakkais-ja varalaitteena vuonna 2022 kliiniselle mikrobiologialle hankitulle NextSeq 2000 –sekvensointilaitteelle. Suorahankinnan peruste on hankintalain 40§ 2 mom 2 kohta teknisestä tai yksinoikeuden suojaamiseen liittyvästä syystä vain tietty toimittaja voi toteuttaa hankinnan; lisäedellytyksenä on, että järkeviä vaihtoehtoisia tai korvaavia ratkaisuja ei ole eikä kilpailun puuttuminen johdu hankinnan ehtojen keinotekoisesta kaventamisesta. Laitteistolla sekvensoidaan verestä, erilaisista kudoksista ja sikiönäytteistä eristetystä DNA:sta ja RNA:sta geenejä, joiden virheet liittyvät synnynnäisiin oireyhtymiin ja syöpätauteihin. Laitetta käytetään kliinisen ja koko eksomin sekvensoinnissa ja veritautien geenien sekvensoinnissa. Laitteella parannetaan laboratorion toimintavalmiutta ja –varmuutta laiterikkotilanteissa, sekä vastataan tutkimusten kysynnän kasvusta johtuvaan näytemäärän kasvuun. Hankittavan laitteen suorituskyvyn tulee olla sellainen, että sekä Kliinisen mikrobiologian että Genomiikan testit voidaan sellaisenaan tehdä laitteella. Molemmissa laitteissa tullaan käyttämään samoja sekvensointireagensseja, joille laboratoriossa olevat tutkimukset on validoitu. Ainoastaan sama laitekanta takaa toisiaan vastaavat laitteistojen tekniset ja toiminnalliset ominaisuudet, jolloin vaatimukset suorituskyvystä ja tulostasosta analytiikassa täyttyvät. Hankittavan laitteen suorituskyvyn tulee olla sellainen, että sekä Kliinisen mikrobiologian että Genomiikan testit voidaan sellaisenaan tehdä laitteella. Molemmissa laitteissa tullaan käyttämään samoja sekvensointireagensseja, joille laboratoriossa olevat tutkimukset on validoitu. Ainoastaan sama laitekanta takaa toisiaan vastaavat laitteistojen tekniset ja toiminnalliset ominaisuudet, jolloin vaatimukset suorituskyvystä ja tulostasosta analytiikassa täyttyvät. Edellä mainituista syistä Illumina Finland Oy:n toimittama NextSeq 2000 hankinta on välttämätön sekä ainoa mahdollinen.