WGS kirjastokitit
Terveyden ja hyvinvoinnin laitos · koko Suomi
Perustiedot
- Tarjousten määräaika
- pe 10.1.2025 klo 12.00 (päättynyt)
- Kysymysten määräaika
- ma 9.12.2024 klo 16.00 (päättynyt)
- Hankkija
- Terveyden ja hyvinvoinnin laitos, Y-tunnus 2229500-6
- Toteutuspaikka
- koko Suomi
- Hankintalaji
- Tavarahankinta
- Menettely
- Avoin menettely, EU-hankinta
- Ilmoituksen tyyppi
- Hankintailmoitus
- Arvioitu kokonaisarvo
- Ei ilmoitettu
- Erät
- 2 erää
- Pääasiallinen CPV
- 33696500 Laboratorioreagenssit
- Sopimuskausi
- 48 kuukautta
- Julkaistu
- 26.11.2024
Ilmoituksen teksti
Alkuperäinen teksti Hilmasta, muuttamattomanaHankinnan kohteena ovat sekä erilaisten mikrobien kokogenomisekvensoinnissa, amplikonisekvensoinnissa että
metagenomiikkasekvensoinnissa käytettävät kirjastokitit Terveyden ja hyvinvoinnin laitokselle (THL).
Hankinta on jaettu kahteen (2) osa-alueeseen seuraavasti:
Osa-alue 1: Virusten kokogenomisekvensointiin (WGS) sopivat kirjastokitit
Osa-alue 2: Bakteerien kokogenomisekvensointiin (WGS) sopivat kirjastokitit
Hankinnan kohde on kuvattu tarkemmin tässä tarjouspyynnössä ja sen liitteissä. Tarjoaja voi tarjota vain yhtä tai molempia osa-alueita.
Kumpaankin osa-alueeseen valitaan yksi (1) toimittaja. Valintaperusteena on kokonaistaloudellinen edullisuus, jonka perusteena on paras hinta-laatusuhde.
Sopimuskausi on voimassa määräaikaisena kaksi (2) vuotta, jonka jälkeen sopimus jatkuu toistaiseksi voimassaolevana.
Tarjouspyyntö sisältää seuraavat liitteet:
Liite 1 Jyse 2014 Tavarat (päivitetty versio, huhtikuu 2022)
Liite 2a Osa 1 Virusten WGS Prosessikuvaus
Liite 2b Osa 1 Virusten WGS Testin suorittaminen
Liite 2c Osa 1 Virusten WGS Testin pisteytys
Liite 3a Osa 2 Bakteerien testattavat kannat ja ohjelmistot
Liite 3b Osa 2 Bakteerien WGS Prosessikuvaus
Liite 3c Osa 2 Bakteerien WGS Testin suorittaminen
Liite 3d Osa 2 Bakteerien WGS Testin pisteytys
Liite 4 Handi-palvelun kuvaus
Liite 5 Sopimusluonnos
Erien kuvaukset
Erä 1: Osa-alue 1: Virusten kokogenomisekvensointiin (WGS) sopivat kirjastokitit
THL:n virologian laboratoriossa sekvensoidaan virusgenomeja sekä seuranta- että valmiustoiminnan puitteissa. Potilas- ja jätevesinäytteiden luonteesta johtuen näytteiden viruspitoisuus voi olla pieni ja virusgenomit osittain degeneroituneita.
Virusten sekvensoinnissa käytettävät kirjastokitit sisältävät kitit, jotka soveltuvat amplikoni ja metagenomiikkasekvensointiin. Reagenssikitin tulee soveltua virusten WGS prosessikuvaukseen (liite 2a).
Nykyinen analyysimäärä on noin 2 400 näytettä/vuosi. Kulutus on tällä hetkellä laskusuuntainen, mutta se saattaa poikkeustilanteissa nousta merkittävästi.
Lisätiedot
Sopimus on voimassa määräaikaisena kaksi (2) vuotta, jonka jälkeen se jatkuu toistaiseksi voimassa olevana.
Erä 2: Osa-alue 2: Bakteerien kokogenomisekvensointiin (WGS) sopivat kirjastokitit
Näitä kittejä tullaan käyttämään THL:n Asiantuntijamikrobiologian yksikössä bakteriologian tiimissä, bakteerien seuranta- ja epidemiaselvitystyössä käytettäviin kokogenomisekvensointiin perustuviin analyyseihin.
Tämä työ on monella bakteerilajilla akkreditoitua, joten reagensseilla tehtävän työn pitää täyttää kullekin bakteerilajille esitetyt laatuvaatimukset ja reagenssikitin tulee soveltua WGS prosessikuvaukseen (liite 3b).
Arvio hankittavasta määrästä on noin 1000 näytettä/vuosi.
Lisätiedot
Sopimus on voimassa määräaikaisena kaksi (2) vuotta, jonka jälkeen se jatkuu toistaiseksi voimassa olevana.
Erät
| Erä | Nimi | Ammattiala | Arvioitu arvo | CPV |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Osa-alue 1: Virusten kokogenomisekvensointiin (WGS) sopivat kirjastokitit Ratkaistu | – | – | 33696500 |
| 2 | Osa-alue 2: Bakteerien kokogenomisekvensointiin (WGS) sopivat kirjastokitit Keskeytetty | – | – | 33696500 |
Hankinnan vaiheet
-
Hankintailmoitustämä ilmoitus
Tarjouspyyntö julkaistiin, määräaika 10.1.2025 klo 12.00.
-
Voittaja: BioNordika Oy.